Το 52ο Λύκειο Αθηνών αρχικά ιδρύθηκε το 1972 ως μεικτό γυμνάσιο Κολωνού. Από το 1977 και μετά λειτούργησε το μεικτό Λύκειο Κολωνού που συστεγαζόταν με το 52ο γυμνάσιο Κολωνού.Το 1983 έγινε 52ο Λύκειο Αθηνών και λειτουργούσε μαζί με το γυμνάσιο μέχρι το 2006 όπου παραδόθηκε το σημερινό κτήριο.
Το κτήριο που βρίσκετε σήμερα το 52ο Λύκειο Αθηνών σχεδιάστηκε το 2003 και άρχισε η κατασκευή του το 2004 με χρηματοδότηση της Ο.Σ.Κ.(Οργάνωση Σχολικών Κτηρίων) και της Ε.Ε. η οποία έδωσε το 50%.
Το κτήριο τέλειωσε και παραδόθηκε τον Σεπτέμβριο του 2006 ενώ πριν χτιστεί το σχολείο εκεί που είναι σήμερα , υπήρχαν οικόπεδα και κατασκευές σπιτιών.
Το κτήριο χτίστηκε κοντά στον λόφο που έχει πολλά δέντρα και προσφέρει μια υπέροχη θέα η όποια δεν φαίνεται λόγω του ότι υπήρχαν και κάποια προβλήματα κατά την κατασκευή του.